Sí, y es muy simple.
Desdeel Menú » Edit » Account Settings en Thunderbird debajo del emailque quieres alterar, vas a ver la opción “Copies & Folders”,una vez que hagas click allí vas a ver varias opciones apareciendo ala derecha.Seleccioná “keeping a copy” y en “Selecto Folder”selecciona “Local Folders”. Podés hacer lo mismo para losborradores y plantillas si querés.